Wariancja międzygrupowa (zwana również wariancją międzyobiektową) – miara rozproszenia danych między różnymi grupami, związana z analizą wariancji (ANOVA).

Wariancja międzygrupowa jest miarą tego jak duże są różnice między porównywanymi grupami. Jest ona obliczana na podstawie różnicy między średnią arytmetyczną wyników w każdej grupie z osobna a ogólną średnią arytmetyczną dla wszystkich grup. Im większe są różnice między porównywanymi grupami, tym większa jest również wariancja międzygrupowa.

W teście ANOVA, wariancja międzygrupowa porównywana jest z wariancją wewnątrzgrupową, czyli miarą zróżnicowania wyników w obrębie poszczególnych grup. Im stosunek wariancji międzygrupowej (różnic między grupami) do wariancji wewnątrzgrupowej (zróżnicowanie wyników wewnątrz grup) jest większy, tym różnice między grupami są większe. Jednak aby zweryfikować hipotezę dotyczącą różnic między grupami, samo policzenie stosunku tych wariancji do siebie (wartości F) jest niewystarczające. Oprócz tego, wymagane jest obliczenie i interpretacja wartości p dla testu ANOVA.

Termin wariancji międzygrupowej jest ściśle powiązany z pojęciem czynnika międzyobiektowego, zazwyczaj przez badaczy traktowanego jako synonim zmiennej niezależnej.

Warto także wiedzieć, iż wariancja międzygrupowa stanowi podstawę obliczenia wskaźnika siły efektu η² (eta-kwadrat), który jest miarą wielkości różnicy między porównywanymi grupami.